Первые активности Caritas в Черногории связаны с 1979 годом и сильным землетрясением, которое затронуло южную часть страны. Следующий значительный этап в развитии деятельности Caritas пришёлся на период с 1993 по 1998 год, когда осуществлялось распределение гуманитарной помощи беженцам из Хорватии, Боснии и Герцеговины, а позднее и из Косово.
Caritas Которской епархии был официально зарегистрирован как «НПО Caritas Которской епархии» 24 января 2014 года и действует в составе Caritas Черногории.
С 2011 года Caritas Черногории стал самостоятельной организацией, поскольку до этого он действовал в рамках структуры Caritas в Югославии, а позднее в Сербии и Черногории. До 2003 года основными направлениями деятельности Caritas были экстренные программы гуманитарной помощи беженцам, вынужденным переселенцам, а также малообеспеченному местному населению. Со временем были разработаны и другие сервисы и механизмы, поэтому помощь сегодня оказывается через различные формы поддержки.
Сегодня сфера деятельности Caritas Которской епархии охватывает различные программы и инициативы: развитие гражданского общества и социальной экономики, продвижение психического здоровья, помощь ромскому населению, работа с молодёжью, работа с мигрантами, развитие социальных услуг для пожилых людей и людей с инвалидностью, продвижение и развитие волонтёрства, экстренная помощь людям, оказавшимся в трудной ситуации, адвокация и представительство интересов, образование и здравоохранение.
Центральный офис Caritas Которской епархии находится в монастыре Святого Николая.
Центральный офис Caritas Черногории находится в городе Бар и служит координационным центром для двух епархиальных организаций Caritas – Caritas Барской архиепархии и Caritas Которской епархии, через которые Caritas реализует свои проекты и программы в Черногории.